《方案》指出，国家致病菌识别网是以网络化信息平台为依托，采用病原识别、分子分型、基因组流行病学等新型调查分析技术，开展细菌性传染病监测与防控的实验室网络，分为国家级、省级和地市级。国家中心实验室设在中国疾控中心，由传染病预防控制所负责;省级和地市级实验室分别设在省级、地市级疾控中心。识别网中病例信息及其菌株来源主要为属地医疗机构;同时遴选工作基础好的医疗机构为哨点医院，常规开展相关病例信息及菌株收集工作。
致病菌识别网要推广应用病原细菌感染检测、耐药分析、分子分型、基因组流行病学等监测技术，提高细菌性传染病检测、监测和疫情溯源能力。监测网络信息系统要开展大数据采集和分析，实现信息共享，实行实时分析，提高疫情监测与分析的精准性。推进传染病流行病学调查分析与实验室监测的深入整合，形成更为灵敏准确的传染病监测新模式，提高暴发疫情发现和来源识别能力。促进疾控机构与医疗机构进一步协同配合，提高细菌性传染病监测和疫情处置综合能力等。
