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解密鸟枪法宏基因组学

放大字体  缩小字体 发布日期:2018-01-12
核心提示:宏基因组学自第一次使用15年后,人们运用该技术对复杂的微生物群落进行了研究。本文章讨论了鸟枪法宏基因组学研究过程中遇到的局限性问题,并对未来的宏基因组学进行展望。尽管组学研究表面看起来较为简单,但由于潜在的实验偏差以及分析解释的复杂性,鸟枪法宏基因组学仍存在着一定的局限性。本篇综述对鸟枪法宏基因组学进行了简单讲解,进一步加深了我们对该技术的认识。
   一、导读
 
  宏基因组学自第一次使用15年后,人们运用该技术对复杂的微生物群落进行了研究。本文章讨论了鸟枪法宏基因组学研究过程中遇到的局限性问题,并对未来的宏基因组学进行展望。尽管组学研究表面看起来较为简单,但由于潜在的实验偏差以及分析解释的复杂性,鸟枪法宏基因组学仍存在着一定的局限性。本篇综述对鸟枪法宏基因组学进行了简单讲解,进一步加深了我们对该技术的认识。
 
  二、论文ID
 
  原名:Shotgun metagenomics, from sampling to analysis
 
  译名:从采样到分析介绍鸟枪法宏基因组学
 
  期刊:Nature Biotechnology
 
  IF:41.667
 
  发表时间:2017年
 
  通信作者:Christopher Quince
 
  通信作者单位:Warwick Medical School, University of Warwick, Warwick,UK
 
  三、综述结构
  四、综述内容
 
  1 鸟枪法宏基因组学试验设计
 
  试验设计一直在试验过程中扮演着重要的角色。在相同环境中的样品之间微生物含量可能会出现差异,这使得研究小样本组之间的显着差异变得十分复杂。因此,对于是否能检测到小样本间的差异变得格外重要。在可行的情况下,我们建议将纵向研究纳入样本中,而不是简单的研究横断面来比较两个样本差异。纵向研究不依赖单个样本的结果,异常值不具有代表性,同时排除了多余变量存在的影响。研究样本类型的多样化体现出收集详细和准