为了满足对猪肉产品进行DNA溯源的要求，来自上海市农业科学院生物技术研究所的吴潇、吕贝贝、王金斌等率先进行了新SNP溯源标记的研究工作。
1SNP标记的挖掘
通过克隆子测序和序列比对分析，发现了33 个可以用PCR-RFLP方法识别的新SNP位点。其中有6 个SNP标记复合溯源标记的要求，6 个SNP标记等位基因分布均衡，杂合度最大为0.5000，最小为0.2449。杂合度低于0.3的有两个，是SNP2和SNP3两个位点在杜大申群体中的杂合度，除此之外，这两个位点除了杜大申群体中杂合度稍低于0.3，其他群体中的杂合度都大于0.3，而且杂合度平均值分别为0.4019和0.4139，均大于0.3，所以这两个位点也是符合溯源标记要求的。并且可以用于猪肉产品的溯源。
2溯源模拟实验结果
先在100 头猪个体中检测了18 个SNP的基因型，个体的基因型可以表示为：212323222233113232。结果显示这18 个SNP标记能鉴别出这100 头猪个体。同时测定了10 份组织器官样品，通过查找和比对，10 个样品都能在100 头猪个体的基因型中找到基因型匹配的个体。
结 论
研究者根据个体DNA的特异性和组织无差异性建立了DNA溯源技术，使得追溯不受动物分割的限制，因此DNA溯源技术被越来越多的国家广泛应用到肉产品的溯源中。近年来SNP标记作为分析生物遗传多样性的分子标记，已被广泛用于猪的遗传学研究中。但是不是所有的SNP标记都可以用作溯源，因此需要建立群体对SNP标记进行筛选，只有符合品种内变异度高，品种间等位基因分布差异小，杂合度大于0.3的SNP标记才能用于DNA溯源。
本实验筛选出12 个可以用于溯源的SNP标记。同时，针对缺乏SNP溯源标记的染色体进行了新SNP标记的挖掘。发现了33 个可以用PCR-RFLP方法识别的新SNP位点。筛选到6 个可以用于溯源的SNP标记。将文献中筛选获得的12 个已有的SNP标记和6 个新SNP标记结合在一起形成一个SNP溯源标记的组合。溯源模拟结果显示这18 个SNP标记能有效区分这100 头猪个体。
