最近，许多研究表明，食品乳化剂可能引起许多与肠屏障功能受损和/或肠道微生物群改变（如过敏性疾病、自身免疫性疾病和炎症性肠道疾病）相关疾病的发病率上升。此外，它们还可以增加对食物中污染物的吸收。
由于肠腔含有大量有害物质（如细菌、毒素、过敏原），胃肠道的一个基本功能是使这些物质远离体内（屏障功能）。如果屏障功能受到干扰，就为许多疾病的发展打开了大门。
表面活性剂食品乳化剂是应用最广泛的食品添加剂之一。与所有授权的食品添加剂一样，乳化剂也经过了风险评估师的评估，他们认为乳化剂是安全的。然而，科学家们越来越担心它们可能对肠屏障和微生物群落产生有害影响。此外，乳化剂可能是导致过敏性疾病、腹腔疾病、I型糖尿病和克罗恩病等疾病发病率上升的主要原因之一。此外，最近有研究表明，食品乳化剂可能有助于代谢综合征的发展，并可促进结肠炎相关的结直肠癌。
来自匈牙利国家食品链安全办公室，食品安全风险评估局的Katalin F. Csáki?、 éva Sebestyén对食品乳化剂对肠屏障可能影响的现有科学知识，以及监管风险评估方法进行了综述。主要目的是揭示风险评估师与科学界观点不一致的原因。研究人员谨提请学术界注意，需要对每一种食品乳化剂进行具体的体内和/或临床研究，以帮助风险评估人员作出充分的评估，并确定授权的食品乳化剂对消费者的健康是安全的。
许多科学研究表明，食用食品乳化剂会损害肠道屏障功能和改变肠道微生物群，从而导致多种疾病（如1型糖尿病、腹腔疾病、IBD等自身免疫性疾病）。此外，它们还可以增加包括内分泌干扰物和致癌物在内的几种环境毒素的吸收。然而，授权过程的初始毒性测试无法证明这些可能的影响。只有通过特定的毒性试验才能证明对肠屏障和微生物群的影响。由于对行业没有这样的要求，风险评估师正在等待来自学术界的这些数据。
