致病性大肠埃希氏菌属主要分为五大类：
1、产肠毒素大肠埃希氏菌(ETEC)
2、肠道侵袭性大肠埃希氏菌(EIEC)
3、肠道致病性大肠埃希氏菌(EPEC)
4、肠道出血性大肠埃希氏菌(EHEC)
5、肠粘附性大肠埃希氏菌(EAEC)
致病大肠埃希菌种类及侵袭部位
菌株侵袭部位疾病与症状致病机制
ETEC小肠旅行者腹泻、婴幼儿腹泻、水样便、腹痛等LT、ST
EPEC小肠婴幼儿腹泻、水样便发热、呕吐病菌黏附、破坏细胞
EIEC结肠志贺样腹泻，脓血便黏附、内毒素破坏细胞
EHEC结肠出血性结肠炎等志贺样毒素(VERO毒素)
EAEC小肠婴儿腹泻、水样便、脱水黏附、毒素
致病性大肠埃希氏菌的致病性是一个很复杂的问题，也并非由某一方面的因素所决定。肠外感染：多为机会感染，表现为泌尿系感染(多见)，胆囊炎、腹膜炎等。肠内感染：由致病大肠埃希菌引起，表现为腹泻。
致病性大肠杆菌与非致病性大肠杆菌在形态、培养特性及生化特性上是不能区别的，采用血清学方法按抗原性质来区分，或者通过分子生物学方法进行基因鉴定。
最新国家标准GB4789.6-2016《食品微生物学检验致泻大肠埃希氏菌检验》中检测程序如下：
经过增菌、分离和生化鉴定后，再通过PCR确认试验，并选做血清学试验，最终得出检验报告。
