传统的培养方法的优点为检测对象都为活菌（因为死菌不可培养），但是它的缺点是耗时较长以及容易造成假阴性，这是由于大部分环境中的微生物处于“VBNC”（viable but nonculturable）状态，这种状态的细菌不能进行培养，却仍旧保存活力，经过一定条件的复苏可以重新恢复活力，采用培养法检测，会造成漏检。
而不经培养直接进行分子检测是对微生物的DNA进行检测，因其高灵敏度和快捷等优点，广受各实验室青睐。但是在实际检测过程中，该方法容易造成假阳性，如死菌的DNA还未彻底降解，而这类DNA容易被分子方法检测到。
为了更好的发挥分子检测的优势，我所研究人员开发了一套独特的检测方法（TK II），用来克服死菌造成的假阳性问题。我们构建了四组分子检测实验：
1.死菌（浓度从107~101），采用普通分子检测流程（TK I）；
2.活菌（浓度从107~101），采用普通分子检测流程（TK I）。
3.死菌（浓度从107~101），采用我们特殊的分子检测流程（TK II）；
4.活菌（浓度从107~101），采用我们特殊的分子检测流程（TK II）。
实验结果见下图，当死菌的浓度在106~103 CFU/mL之间时，利用TK II 检测方法，均为阴性，而用该方法对活菌进行检测时，检测结果不受影响，即和TK I 检测结果一致。
这套体系的建立，显着的克服了分子检测容易造成假阳性的缺点，为我所的分子检测的发展也奠定了一个良好的基础。
( TK I 与TK II 检测结果 )
M：100bp DNA ladder；
1~4：菌液浓度为107 CFU/mL；
5~8：106 CFU/mL；
9~12：105 CFU/mL；
13~16：104 CFU/mL；
17~20：103 CFU/mL；
21~24：102 CFU/mL；
25~28；101 CFU/mL；
29：NTC
1、5、9、13、17、21、25：TK I；
2、6、10、14、18、22、26：TK I；
3、7、11、15、19、23、27：TK II；
4、8、12、16、20、24、28：TK II。
