热搜: 食品  烟台  奶粉  保健品  海产品  周黑  黑窝点  黑作坊  全聚德  小龙虾 
 
当前位置: 首页 » 检测应用 » 检测技术 » 实验室常识 » 正文

WB经验之上样

放大字体  缩小字体 发布日期:2017-07-05
核心提示:蛋白定量首先需要一个参照系(标准蛋白),参照蛋白通常选择BSA,也就是说你所谓的定量是对应于BSA的浓度的一个参照值。
   样品是否一定需要定量再上样?
 
  ——不是的,这是浪费时间的一个操作。 我们首先来讨论一下蛋白定量的科学性。
 
  蛋白定量首先需要一个参照系(标准蛋白),参照蛋白通常选择BSA,也就是说你所谓的定量是对应于BSA的浓度的一个参照值。这里面存在一个问题,即忽略了蛋白折叠和空间构象对光吸收、折射的影响;不同的蛋白折叠和构象还会影响颜料分子的嵌入。因此你其实默认将所有的蛋白等同于BSA在溶液中的折叠状态、光吸收情况下,然后做出的一个相对判断,这就存在一个“系统误差”——还不算上测量误差等等,就已经很不准确了。 其次,裂解组织或细胞的时候,那些裂解液中,某些溶剂本身会使CoomassieG250或者Bradford法(实际也是Coomassie染色)显色,尤其是去污剂之类;例如NP40,就会使Coomassie显蓝色,可以完全覆盖掉蛋白与Coomassie作用产生的蓝色。因此,如果你的裂解液里面含有这类物质,所谓的蛋白定量实际是NP40颜色和蛋白染色的叠加,根本不会符合标准蛋白曲线的线性规律,自然定不准。【需要说明:我目前只知道NP40会这样,因为我们从来不去定量,没有做过更深入的研究。】
 
  实际上保证你的内参一致,是从样品制备开始的,上节末尾有提到,不赘述。如果你从制备样品时就注意过定量问题,实际上通常内参差别不会太大。如果真的有差别,通常我们会先跑少量的样品,目的是让Actin或tubulin更清晰、不会粘连、不会过曝光。从而在第二轮跑正式结果前,根据第一轮的内参的荧光信号做微调,大致能做到相当;最多可能需要第三轮。以上的试验可以精确到0.1ul差异(我很多体外生化试验之前的调整酶量就是这样进行,此时根本不可能有足够的蛋白让你去定量)。当然凭曝光强弱调整上样量的前提是,你的WB技术很稳定,很可靠,这是需要相当多的经验积累,如果你一时掌握不了,可以让经验更丰富的师兄师姐或者导师帮忙。
 
  顺便提到,有人问过用Quantity One等定量软件对光密度定量后计算差别从而调整上样体积是否可以?——不可以。因为WB结果经过多重放大,精确计量只代表相对于对照组的相对比值,与实际比值还是有误差,所以按计算值更改上样量仍会出现偏差。
 
  如果非要做定量的话,要注意你的裂解液配方,把每种溶剂都先加入到显色液中尝试一下,避免那些本身会显色的物质出现在你的裂解液中;当然,某些物质的去除可能影响对组织蛋白的提取。所以这是一个两难的问题。
 
 
[ 检测应用搜索 ]  [ 加入收藏 ]  [ 告诉好友 ]  [ 打印本文 ]  [ 违规举报 ]  [ 关闭窗口 ]

 
0条 [查看全部]  相关评论

 
推荐图文
推荐检测应用
点击排行
  

鲁公网安备 37060202000213号