近日，广东省农业科学院作物所科技人员在国际著名期刊《Plant Biotechnology Journal》 （JCR一区，IF9.803）在线发表花生单细胞基因表达研究成果，在国际上首次绘制了花生叶片单细胞基因表达图谱。作物所刘浩博士，联合培养研究生胡冬秀、杜普旋为共同第一作者。作物所洪彦彬研究员、陈小平研究员，国际半干旱热带作物研究所Rajeev Varshney院士为共同通讯作者。
花生是我国重要的油料经济作物，栽培种花生为异源四倍体豆科作物，开展花生功能基因表达研究具有重要意义。作物所花生团队在前期开展花生二倍体野生种、四倍体栽培种全基因组测序解研究结果的基础上，再利用单细胞测序技术（scRNA-seq）对花生叶片细胞的基因表达谱进行研究。单细胞测序转录组测序（Single-cell RNA sequencing）是近年来研究基因表达量的新方法，与传统的组织转录组测序（Tissue Bulk RNA sequencing）相比，可在单个细胞内研究基因表达之间的异质性问题。
本研究建立了稳定的花生叶片原生质体细胞分离方法，并利用scRNA-seq技术捕获了6815个细胞，构建了第一张花生单细胞基因表达图谱。此外，对花生叶肉细胞与叶片细胞的拟时序发育轨迹进行了分析，并鉴定到了重要的转录因子AHL23（AT-hook transcription factor）。本研究获得了广东省重点研发计划、国家自然科学青年基金、广东省国际合作项目、广东省基础与应用基础研究项目、国家现代农业产业技术体系、广东省农业科学院“十四五”农业优势产业学科团队、广东省农业科学院人才培养专项等项目的支持。
原文连接https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/pbi.13656
单细胞测序技术鉴定花生叶片亚细胞类型
花生叶肉细胞与表皮细胞拟时序发育轨迹及发育模型
