美国伊利诺伊大学兽医学院临床医学系兽医诊断实验室病毒部 主任
现任美国伊利诺伊大学兽医学院临床医学系助理教授，兽医诊断实验室病毒部主任，美国兽医微生物学院病毒学认证专家。在国际着名《Biomaterials》、《Emerging Infectious Diseases》、《Emerging Microbes and Infections》、《Journal of Virology》、《Vaccine》等SCI杂志上共发表54 篇论文，主编及参编5 本中文/英文书，具有美国专利1 项。现任美国国立卫生研究院（NIH）基金评审专家，《Food Science and Human Wellness》期刊执行副主编、《Medical Research & Publication》期刊副主编、《Medicine, Scientific Reports》、《Journal of Veterinary Diagnostic Investigation》、《World Journal of Virology》、《Journal of Clinical and Translational Hepatology》等多个期刊编委会成员。国际上首次发现美国PEDV变异毒株、在有腹泻病的猪中发现猪Delta冠状病毒以及发现新的麻雀Delta冠状病毒。有多年的动物疫苗研究经历，并在国际上首次使用蛋白质同源二聚体特性来构建重组蛋白质大分子用于疫苗开发。自2015年以来，使用二代测序平台技术对病原微生物进行测序并作生物信息学分析，尤其是对食品原微生物进行全基因组测序分析。现主持FDA iSeq沙门氏菌测序项目。
报告题目
使用高通量测序技术鉴定食品源致病菌
摘 要
美国疾病控制中心数据显示，食源性病菌在美国每年导致大约4800万人生病，12.8万人住院，3千人死亡。在导致食源性疾病的31 种病原中，有20多种是细菌病原，这些细菌是导致2000—2008年期间64％的住院和死亡的主要原因。由于脉冲场凝胶电泳（PFGE）方法具有很强的区分能力，很好的重复性及分类性能，因此PFGE通常被用作追踪分析食源性病原菌的“金标准”方法。然而自2005年以来，新一代测序（NGS）技术的出现对生物医学领域起到了巨大的推动作用，尤其是将微生物诊断相关的调查研究工作提高到新的水平。目前NGS包括二代和三代测序技术，其中二代测序技术是对DNA模板进行扩增后测序，而三代测序技术是对DNA模板直接进行测序。目前市场上有各种测序技术平台，比如二代测序平台有离子半导体测序、基于连接原理的SOLiD测序及Illumina公司的边合成边测序；三代测序技术平台有PacBio的单分子实时测序及牛津纳米孔测序技术。与传统的PFGE及MLVA和MLST分子生物学方法相比，新一代测序技术测出的细菌全基因组对食品源细菌具有更高的区分鉴别能力，而且也有更好的可重复性。本报告主要介绍临床中使用NGS对食品源弯曲菌、李氏杆菌及沙门氏菌进行测序鉴定。
